Publications - Microscopy and Microanalysis
| All publications are registered in on-line ASEP database. | 
Journal Article 
2025
Chilala, P., Juříčková, M., Pokorná, Z.,  Motlová, T., Horký, P., Skaličková, S. Antioxidant properties and  antimicrobial activity of selenium nanoparticles synthetized via Zambian  medicinal herbs. PLoS ONE. 2025, 20(6), e0325460. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203. Available from: https://doi.org/10.1371/journal.pone.0325460.
Košelová,  Z., Allaham, M. M., Burda, D., Pokorná, Z., Sobola, D., Knápek, A.,  Fohlerová, Z. Tailoring Tungsten Oxide Layers for Cold Field Emission  Cathodes: Anodization and Thermal Oxidation Approaches. ACS Applied Electronic Materials. 2025, 7(9), 4013-4024. E-ISSN 2637-6113. Available from: https://doi.org/10.1021/acsaelm.5c00241.
2024
Pokorná,  Z., Knápek, A., Mika, F., Chlumská, J., Konvalina, I., Walker, C. G.  H., Jaber, A. M. D. Determination of Crystallographic Information by  Means of Very Low Energy Electron Imaging. Jordan Journal of Physics. 2024, 17(2), 233-244. ISSN 1994-7607. E-ISSN 1994-7615. Available from: https://doi.org/10.47011/17.2.10.
2023
Benešová,  M., Bernatová, S., Mika, F., Pokorná, Z., Ježek, J., Šiler, M., Samek,  O., Růžička, F., Rebrošová, K., Zemánek, P., Pilát, Z. SERS-Tags:  Selective Immobilization and Detection of Bacteria by Strain-Specific  Antibodies and Surface-Enhanced Raman Scattering. Biosensors. 2023, 13(2), 182. E-ISSN 2079-6374. ABSTRACT
Nohl,  J. F., Farr, N. T. H., Sun, Y., Hughes, G. M., Stehling, N., Zhang, J.,  Longman, F., Ives, G., Pokorná, Z., Mika, F., Kumar, V., Mihaylova, L.,  Holland, C., Cussen, S. A., Rodenburg, C. Insights into surface  chemistry down to nanoscale: An accessible colour hyperspectral imaging  approach for scanning electron microscopy. Materials Today Advances. 2023, 19(August), 100413. ISSN 2590-0498. E-ISSN 2590-0498. ABSTRACT
2022
Boriová, S., Outram, A., Pokorná, Z., Sázelová, S. Bone Fractures under the Microscope. An Experimental Approach to Mid-Upper Paleolithic Faunal Remains. Študijné zvesti Archeologického ústavu Slovenskej akadémie vied. 2022, 69(2), 187-204. ISSN 0560-2793. ABSTRACT
2021
Řiháček, T., Horák, M., Schachinger, T., Mika, F., Matějka, M., Krátký, S., Fořt, T., Radlička, T., Johnson, C. W., Novák, L., Seďa, B., Mcmorran, B.J., Müllerová, I. Beam shaping and probe characterization in the scanning electron microscope. Ultramicroscopy. 2021, 225(June), 113268. ISSN 0304-3991. E-ISSN 1879-2723. ABSTRACT
Šimonová, L., Matějka, M., Knápek, A., Králík, T., Pokorná, Z., Mika, F., Fořt, T., Man, O., Škarvada, P., Otáhal, A., Čudek, P. Nanostructures for Achieving Selective Properties of a Thermophotovoltaic Emitter. Nanomaterials. 2021, 11(9). ISSN 2079-4991. ABSTRACT
2020
Frank, Luděk, Hovorka, Miloš, El Gomati, M. M., Müllerová, Ilona, Mika, Filip, Mikmeková, Eliška. Acquisition of the dopant contrast in semiconductors with slow electrons. Journal of Electron Spectroscopy and Related Phenomena. 2020, 241(MAY), 146836. ISSN 0368-2048. ABSTRACT
2019
Abrams, K.J., Dapor, M., Stehling, N., Azzolini, M., Kyle, S.J., Schäfer, J.S., Quade, A., Mika, Filip, Krátký, Stanislav, Pokorná, Zuzana, Konvalina, Ivo, Mehta, D., Black, K., Rodenburg, C. Making Sense of Complex Carbon and Metal/Carbon Systems by Secondary Electron Hyperspectral Imaging. Advanced Science. 2019, 6(19), 1900719. ISSN 2198-3844. ABSTRACT
Konvalina, Ivo, Mika, Filip, Krátký, Stanislav, Materna-Mikmeková, Eliška, Müllerová, Ilona. In-Lens Band-Pass Filter for Secondary Electrons in Ultrahigh Resolution SEM. Materials. 2019, 12(14), 2307. ISSN 1996-1944. ABSTRACT
2018
Dapor, M., Masters, R., Ross, I., Lidzey, D., Pearson, A., Abril, I.,  Garcia-Molina, R., Sharp, J., Unčovský, M., Vystavěl, T., Mika, Filip,  Rodenburg, C. Secondary electron spectra of semi-crystalline polymers A  novel polymer characterisation tool?i.Journal of Electron Spectroscopy  and Related Phenomena. 2018, 222(JAN), 95-105. ISSN 0368-2048. ABSTRACT
Franc,  A., Muselík, J., Zeman, J., Lukášová, I., Kurhajec, S., Bartoníčková,  E., Galvánková, L., Mika, Filip, Dominik, M., Vetchý, D. The effect of  amorphous and crystal sodium warfarin and its content uniformity on  bioequivalence of tablets. European Journal of Pharmaceutical Sciences.   2018, 125(DEC), 120-129. ISSN 0928-0987. ABSTRACT
Walker,  Christopher, Konvalina, Ivo, Mika, Filip, Frank, Luděk, Müllerová,  Ilona. Quantitative comparison of simulated and measured signals in the  STEM mode of a SEM. Nuclear Instruments & Methods in Physics  Research Section B.  2018, 415(JAN), 17-24. ISSN 0168-583X. ABSTRACT
2017
Lukášová, I.; Muselík, J.; Franc, A.; Goněc, R.; Mika, Filip; Vetchý, D. Factor analysis in optimization of formulation of high content uniformity tablets containing low dose active substance. European Journal of Pharmaceutical Sciences, 2017, vol. 109, NOV, pp. 541-547. ISSN 0928-0987. ABSTRACT
Schäfer, J.; Fricke, K.; Mika, Filip; Pokorná, Zuzana; Zajíčková, L.; Foest, R. Liquid assisted plasma enhanced chemical vapour deposition with a non-thermal plasma jet at atmospheric pressure. Thin Solid Films, 2017, vol. 630, MAY 30, pp. 71-78. ISSN 0040-6090. ABSTRACT
2016
Buršík,  Josef; Soroka, Miroslav; Uhrecký, Róbert; Kužel, R.; Mika, Filip;  Huber, Š. Thin (111) oriented CoFe2O4 and Co3O4 films prepared by  decomposition of layered cobaltates. Applied Surface Science. 2016, vol. 376, JUL, pp. 209-218. ISSN 0169-4332. ABSTRACT
Mika, Filip. Recent Trends 2016. Akademický bulletin AV ČR. 2016, č. 7-8, s. 15. ISSN 1210-9525. 
2015
Brzobohatý,  Oto; Šiler, Martin; Trojek, Jan; Chvátal, Lukáš; Karásek, Vítězslav;  Paták, Aleš; Pokorná, Zuzana; Mika, Filip; Zemánek, Pavel.  Three-Dimensional Optical Trapping of a Plasmonic Nanoparticle using Low  Numerical Aperture Optical Tweezers. Scientific Reports. 2015, vol. 5, JAN 29, 08106:1-9. ISSN 2045-2322. ABSTRACT
Buršík,  Josef; Soroka, Miroslav; Kužel, R.; Mika, Filip. Growth and  characterization of thin oriented Co3O4 (111) films obtained by  decomposition of layered cobaltates NaxCoO2. Journal of Solid State Chemistry. 2015, vol. 227, JUL, pp. 17-24. ISSN 0022-4596. ABSTRACT
Frank, Luděk; Mika, Filip; Müllerová, Ilona. Optimizing the Recognition of Surface Crystallography. Microscopy and Microanalysis. 2015, vol. 21, S4, pp. 124-129. ISSN 1431-9276. ABSTRACT
Frank,  Luděk; Nebesářová, Jana; Vancová, Marie; Paták, Aleš; Müllerová, Ilona.  Imaging of tissue sections with very slow electrons. Ultramicroscopy. 2015, vol. 148, JAN., pp. 146-150. ISSN 0304-3991. ABSTRACT
Mika,  Filip; Walker, Christopher; Konvalina, Ivo; Müllerová, Ilona. Imaging  with STEM Detector, Experiments vs. Simulation. Microscopy and  Microanalysis 2015, roč. 21, S4, s. 66-71. ISSN 1431-9276. ABSTRACT
Vaškovicová,  Naděžda; Krzyžánek, Vladislav; Paták, Aleš. Ice Contamination Issues in  the Visualization of the Ultrastructure of the Nuclear Envelope by  Freeze-Fracture Technique. Microscopy and Microanalysis. 2015, vol. 21, S3, pp. 229-230. ISSN 1431-9276. 
2013
Buršík,  Josef; Vaněk, Přemysl; Mika, Filip. Role of reaction atmosphere in  preparation of potassium tantalate through sol-gel method. Journal of Sol-Gel Science and Technology. 2013, vol. 68, iss. 2, pp. 219-233. ISSN 0928-0707. ABSTRACT
2012
Mika,  Filip; Matějková-Plšková, J.; Jiwajinda, S.; Dechkrong, P.; Shiojiri,  M. Photonic Crystal Structure and Coloration of Wing Scales of  Butterflies Exhibiting Selective Wavelength Iridescence. Materials. 2012, vol. 5, iss. 5, pp. 754-771. ISSN 1996-1944. ABSTRACT
Mika, Filip; Paták, Aleš; Frank, Luděk. Rastrovací elektronový mikroskop s rozlišením pod 1 nm. Jemná mechanika a optika. 2012, roč. 57, č. 10, s. 281-282. ISSN 0447-6441. 
Müllerová,  Ilona; Hovorka, Miloš; Mika, Filip; Mikmeková, Eliška; Mikmeková,  Šárka; Pokorná, Zuzana; Frank, Luděk. Very low energy scanning electron  microscopy in nanotechnology. International Journal of Nanotechnology. 2012, vol. 9, 8/9, pp. 695-716. ISSN 1475-7435. ABSTRACT
2011
Matějková-Plšková,  J.; Mika, Filip; Shiojiri, S.; Shiojiri, M. Fine Structure of Wing  Scales in Chrysozephyrus Ataxus Butterflies. Materials Transactions. 2011, vol. 52, iss. 3, pp. 297-303. ISSN 1345-9678. ABSTRACT
2010
Hovorka, Miloš; Mika, Filip; Mikulík, P.; Frank, Luděk. Profiling N-Type Dopants in Silicon. Materials Transactions. 2010, vol. 51, iss. 2, pp. 237-242. ISSN 1345-9678. ABSTRACT
Proceedings - International Conference
2018
Mika, Filip, Pokorná, Zuzana, eds.  Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation. Proceedings of the 16th International Seminar. Brno:  Institute of Scientific Instruments The Czech Academy of Sciences, 2018.  ISBN 978-80-87441-23-7. ABSTRACT
2016
Mika, Filip (ed.). Proceedings of the 15th International Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation. Brno: Institute of Scientific Instruments CAS, 2016. 80 pp. ISBN 978-80-87441-17-6.
2014
Mika, Filip (ed.); Pokorná, Zuzana (ed.). 9th International Conference on Charged Particle Optics : Book of Abstracts Brno: Institute of Scientific Instruments, AS CR, v. v. i, 2014. 99 pp. ISBN 978-80-87441-11-4.
2012
Mika, Filip (ed.). Proceedings of the 13th International Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation. Brno: Institute of Scientific Instruments AS CR, v.v.i, 2012. 78 s. ISBN 978-80-87441-07-7.
2010
Mika, Filip (ed.). Proceedings of the 12th International Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation. Brno: Institute of Scientific Instruments AS CR, v.v.i, 2010. 70 s. ISBN 978-80-254-6842-5. 
Proceedings Paper - International Conference
2024
Benešová,  M., Bernatová, S., Pilát, Z., Motlová, T., Pokorná, Z., Mika, F.,  Ježek, J., Kizovský, M., Mikulová, A., Samek, O. Analysis of bacteria  using surface-enhanced Raman scattering. In: Mikel, B., ed. LA64. Sborník příspěvků multioborové konference LASER64. Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2024, s. 7-11. ISBN 978-80-87441-34-3.
Šebestová,  H., Horník, P., Mika, F., Mikmeková, Š., Ambrož, O., Mrňa, L.  Microstructure modifications of Al-Si-coated press-hardened steel 22MnB5  by laser welding. In: METAL 2023. 32nd International Conference on Metallurgy and Materials. Conference Proceedings. Ostrava: TANGER, 2024, s. 302-307. ISBN 978-80-88365-12-9. ISSN 2694-9296. 
2023
Benešová,  M., Bernatová, S., Samek, O., Pokorná, Z., Mika, F., Kizovský, M.,  Pilát, Z. SERS-TAGS: Selektivní imobilizace a detekce bakterií pomocí  specifických protilátek a povrchově zesíleného Ramanova rozptylu. In:  Mikel, B., ed. LA63. Sborník příspěvků multioborové konference LASER63. Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2023, s. 9-12. ISBN 978-80-87441-32-9.
Šebestová,  H., Horník, P., Mika, F., Mikmeková, Š., Ambrož, O., Mrňa, L.  Microstructure modifications of Al-Si-coated press-hardened steel 22MnB5  by laser welding. In: METAL 2023. 32nd International Conference on Metallurgy and Materials. Conference Proceedings. Ostrava: TANGER, 2024, s. 302-307. ISBN 978-80-88365-12-9. ISSN 2694-9296.
2018
Horáček, Miroslav, Knápek, Alexandr,  Matějka, Milan, Krátký, Stanislav, Urbánek, M., Mika, Filip, Kolařík,  Vladimír. Hiding e-beam exposure fields by deterministic 2D pattering.  In: Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation. Proceedings of the 16th International Seminar.  Brno:  Institute of Scientific Instruments The Czech Academy of Sciences, 2018,  s. 36-37. ISBN 978-80-87441-23-7. [Recent Trends in Charged Particle  Optics and Surface Physics Instrumentation, Skalský dvůr,  04.06.2018-08.06.2018, CZ]. 
Konvalina, Ivo, Paták, Aleš,  Mikmeková, Eliška, Mika, Filip, Müllerová, Ilona. STEM modes in SEM. In:  Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation. Proceedings of the 16th International Seminar.  Brno:  Institute of Scientific Instruments The Czech Academy of Sciences, 2018,  s. 40-41. ISBN 978-80-87441-23-7. [Recent Trends in Charged Particle  Optics and Surface Physics Instrumentation, Skalský dvůr,  04.06.2018-08.06.2018, CZ]. 
Mika, Filip, Pokorná, Zuzana,  Konvalina, Ivo, Khursheed, A. Possibilites of a secondary electrons  bandpass filter for standard SEM. In: Recent Trends in Charged Particle  Optics and Surface Physics Instrumentation. Proceedings of the 16th  International Seminar.  Brno: Institute of Scientific Instruments The  Czech Academy of Sciences, 2018. ISBN 978-80-87441-23-7. [Recent Trends  in Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation, Skalský  dvůr, 04.06.2018-08.06.2018, CZ]. 
Rodenburg, C., Masters, R.,  Abrams, K., Dapor, M., Krátký, Stanislav, Mika, Filip. Secondary  electron hyper spectral imaging in helios nanolab - mapping materials  properties or artefacts?. In: Recent Trends in Charged Particle Optics  and Surface Physics Instrumentation. Proceedings of the 16th  International Seminar.  Brno: Institute of Scientific Instruments The  Czech Academy of Sciences, 2018, s. 68-69. ISBN 978-80-87441-23-7.  [Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation, Skalský dvůr, 04.06.2018-08.06.2018, CZ].
Řiháček,  Tomáš, Horák, M., Schachinger, T., Matějka, Milan, Mika, Filip,  Müllerová, Ilona. Creation of electron vortex beams using the  holographic reconstruction method in a scanning electron microscope. In:  Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation. Proceedings of the 16th International Seminar.  Brno:  Institute of Scientific Instruments The Czech Academy of Sciences, 2018,  s. 66-67. ISBN 978-80-87441-23-7. [Recent Trends in Charged Particle  Optics and Surface Physics Instrumentation, Skalský dvůr,  04.06.2018-08.06.2018, CZ].
2017
Horáček, Miroslav, Meluzín, Petr,  Krátký, Stanislav, Knápek, Alexandr, Mika, Filip, Chlumská, Jana,  Matějka, František, Král, Stanislav, Brunn, Ondřej, Giričová, D., Kopal,  Jaroslav, Kolařík, Vladimír. Deterministicky aperiodické obrazové  zařízení. In: Růžička, Bohdan ed. Sborník příspěvků multioborové  konference LASER57.  Brno: Ústav přístrojové techniky AV ČR, 2017, s.  34-35. ISBN 978-80-87441-21-3. [LASER57, Třešť, 08.11.2017-10.11.2017,  CZ]. 
Horák, M., Křápek, V., Hrtoň, M., Metelka, O., Šamořil, T.,  Stöger-Pollach, M., Paták, Aleš, Šikola, T. Babinet principle for  plasmonic antennas: complementarity and differences. In: Gajović, A.;  Weber, I.; Kovačević, G.; Čadež, V.; Šegota, S.; Peharec Štefanić, P.;  Vidoš, A. ed. 13th Multinational Congress on Microscopy: Book of  Abstracts.  Zagreb: Ruder Bošković Institute, Croatian Microscopy  Society, 2017, s. 587-588. ISBN 978-953-7941-19-2. [Multinational  Congress on Microscopy /13./, Rovinj, 24.09.2017-29.09.2017, HR].
Konvalina,  Ivo, Paták, Aleš, Mika, Filip, Müllerová, Ilona. STEM modes in SEM –  simulations and experiments. In: Gajović, A.; Weber, I.; Kovačević, G.;  Čadež, V.; Šegota, S.; Peharec Štefanić, P.; Vidoš, A. ed. 13th  Multinational Congress on Microscopy: Book of Abstracts.  Zagreb: Ruder  Bošković Institute, Croatian Microscopy Society, 2017, s. 140-141. ISBN  978-953-7941-19-2. [Multinational Congress on Microscopy /13./, Rovinj,  24.09.2017-29.09.2017, HR]. 
Mikmeková, Eliška, Frank, Luděk,  Polčák, J., Paták, Aleš, Lejeune, M. Examination of 2D crystals in a low  voltage SEM/STEM. In: Gajović, A.; Weber, I.; Kovačević, G.; Čadež, V.;  Šegota, S.; Peharec Štefanić, P.; Vidoš, A. ed. 13th Multinational  Congress on Microscopy: Book of Abstracts.  Zagreb: Ruder Bošković  Institute, Croatian Microscopy Society, 2017, s. 618-619. ISBN  978-953-7941-19-2. [Multinational Congress on Microscopy /13./, Rovinj,  24.09.2017-29.09.2017, HR]. 
2016
Konvalina,  Ivo; Mika, Filip; Krátký, Stanislav; Müllerová, Ilona. Bandpass filter  for secondary electrons in SEM - simulations. In Mika, Filip (ed.).  Proceedings of the 15th International Seminar on Recent Trends in  Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation. Brno:  Institute of Scientific Instruments CAS, 2016, S. 28-29. ISBN  978-80-87441-17-6. [International Seminar on Recent Trends in Charged  Particle Optics and Surface Physics Instrumentation /15./, Skalský dvůr,  29.05.2016-03.06.2016, CZ].
Mika, Filip; Konvalina, Ivo; Krátký,  Stanislav; Müllerová, Ilona. Bandpass filter for secondary electrons in  SEM - experiments. In Mika, Filip (ed.). Proceedings of the 15th  International Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and  Surface Physics Instrumentation. Brno: Institute of Scientific  Instruments CAS, 2016, S. 36-37. ISBN 978-80-87441-17-6. [International  Seminar on Recent Trends in Charged 
Rodenburg, C.; Masters, R.;  Lidzey, D.; Unčovský, M.; Vystavěl, Tomáš; Mika, Filip. Secondary  electron spectroscopy and energy selective imaging for the engineering  of carbon based materials. In Mika, Filip (ed.). Proceedings of the 15th  International Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and  Surface Physics Instrumentation. Brno: Institute of Scientific  Instruments CAS, 2016, S. 58-59. ISBN 978-80-87441-17-6. [International  Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation /15./, Skalský dvůr, 29.05.2016-03.06.2016, CZ].
Řiháček,  Tomáš; Mika, Filip; Matějka, Milan; Krátký, Stanislav; Müllerová,  Ilona. Difraction in a scanning electron microscopie. In Mika, Filip  (ed.). Proceedings of the 15th International Seminar on Recent Trends in  Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation. Brno:  Institute of Scientific Instruments CAS, 2016, S. 56-57. ISBN  978-80-87441-17-6. [International Seminar on Recent Trends in Charged  Particle Optics and Surface Physics Instrumentation /15./, Skalský dvůr,  29.05.2016-03.06.2016, CZ].
Šikula, J.; Grmela, L.; Bartlová,  M.; Kuparowitz, T.; Knápek, Alexandr; Mika, Filip. Noise of Low-Energy  Electron Beam. In 2015 International Conference on Noise and  Fluctuations (ICNF) (Proceedings IEEE). Piscataway: IEEE, 2016. ISBN  978-1-4673-8335-6. [International Conference on Noise and Fluctuations  (ICNF) /23./, Xi’an, 02.06.2015-06.06.2015, CN].
Šiler, Martin;  Brzobohatý, Oto; Chvátal, Lukáš; Karásek, Vítězslav; Paták, Aleš;  Pokorná, Zuzana; Mika, Filip; Zemánek, Pavel. Golden nanoparticle in  optical tweezers: influence of shape and orientation on optical  trapping. In Mika, Filip (ed.). Proceedings of the 15th International  Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation. Brno: Institute of Scientific Instruments CAS, 2016, S.  64-65. ISBN 978-80-87441-17-6. [International Seminar on Recent Trends  in Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation /15./,  Skalský dvůr, 29.05.2016-03.06.2016, CZ].
2015
Konvalina,  Ivo; Mika, Filip; Müllerová, Ilona; Krátký, Stanislav. Band-pass-filter  for secondary electrons in ultra-high resolution SEM. In MC 2015.  Microscopy Conference Proceedings. Göttingen: DGE, 2015, S. 378-379.  [Microscopy Conference 2015, Göttingen, 06.09.2015-11.09.2015, DE].
Řiháček,  Tomáš; Mika, Filip; Matějka, Milan; Krátký, Stanislav; Müllerová,  Ilona. Study of the coherence of the primary beam in the low energy  scanning electron microscope. In MC 2015. Microscopy Conference  Proceedings. Göttingen: DGE, 2015, S. 611-612. [Microscopy Conference  2015, Göttingen, 06.09.2015-11.09.2015, DE].
2014
Knápek,  Alexandr; Mika, Filip; Prášek, J.; Majzlíková, P. SEM characterization  of carbon nanotubes based active layers of chemical sensors. In  Proceedings of the ISSE 2014. 37th International Spring Seminar on  Electronics Technology. Piscataway: IEEE, 2014, S. 361-364. ISBN  978-1-4799-4455-2. [International Spring Seminar on Electronics  Technology /37./, Dresden, 07.05.2014-11.05.2014, DE].
Krátký,  Stanislav; Kolařík, Vladimír; Urbánek, Michal; Paták, Aleš; Horáček,  Miroslav; Matějka, Milan. E-beam Nano-patterning for Electroforming  Replication. In NANOCON 2014. 6th International conference proceedings.  Ostrava: TANGER, 2014. ISBN 978-80-87294-55-0. [NANOCON 2014.  International Conference /6./, Brno, 05.11.2014-07.11.2014, CZ].
Matějková-Plšková,  J.; Mika, Filip; Jiwajinda, S.; Dechkrong, P.; Svidenská, S.; Shiojiri,  M. Photonic Crystal Structure of Butterfly Wing Scales Exhibiting  Selective Wavelength Iridescence. In 18th International Microscopy  Congres. Proceedings. Praha: Czechoslovak Microscopy Society, 2014. ISBN  978-80-260-6720-7. [International Microscopy Congres /18./, Praha,  07.09.2014-12.09.2014, CZ].
Müllerová, Ilona; Radlička, Tomáš;  Mika, Filip; Krzyžánek, Vladislav; Neděla, Vilém; Sobota, Jaroslav;  Zobač, Martin; Kolařík, Vladimír; Starčuk jr., Zenon; Srnka, Aleš;  Jurák, Pavel; Zemánek, Pavel; Číp, Ondřej; Lazar, Josef; Mrňa, Libor.  Main Activites of the Institute of Scientific Instruments. In Workshop  of Interesting Topics of SEM and ESEM. Brno: Institute of Scientific  Instruments AS CR, v. v. i, 2014, S. 7-8. ISBN 978-80-87441-12-1.  [Workshop of Interesting Topics of SEM and ESEM, Mikulov,  26.08.2014-31.08.2014, CZ].
2013
Halašová,  Klára; Pavlova, Ewa; Paruzel, Bartosz; Pfleger, Jiří; Šlouf, Miroslav;  Mikmeková, Šárka; Paták, Aleš. Poly(3-hexylthiophene)/gold nanoparticle  nanocomposites: relationship between morphology and electrical  conductivity. In Benedickt, C.; Fathi, A. (ed.). Proceedings of the  Polymer Processing Society 29th Annual Meeting - PPS-29. Nuremberg: Neue  Materialien Bayreuth, 2013, S06-46. [International Conference of the  Polymer Processing Society /29./ - PPS-29, Nuremberg,  15.07.2013-19.07.2013, DE].
Mika, Filip; Novotný, Peter;  Konvalina, Ivo. Imaging with a STEM detector, experiments vs.  simulation. In Microscopy conference (MC) 2013. Proceedings. Vol. 2.  Regensburg: University of Regensburg, 2013, S. 51-52. [Microscopy  Conference 2013, Regensburg, 25.08.2013-30. 08.2013, DE].
2012
Frank,  Luděk; Mikmeková, Šárka; Mika, Filip; Müllerová, Ilona. Surface  crystallinity at the sight of electrons. In Mika, F. (ed.). Proceedings  of the 13th International Seminar on Recent Trends in Charged Particle  Optics and Surface Physics Instrumentation. Brno: Institute of  Scientific Instruments AS CR, v.v.i, 2012, S. 17-20. ISBN  978-80-87441-07-7. [International Seminar on Recent Trends in Charged  Particle Optics and Surface Physics Instrumentation /13./, Skalský dvůr,  25.06.2012-29.06.2012, CZ]. 
Kolařík, Vladimír; Matějka,  František; Matějka, Milan; Horáček, Miroslav; Urbánek, Michal; Bok, Jan;  Krátký, Stanislav; Král, Stanislav; Mika, Filip. What is the buzz about  the TZ mode. In Mika, F. (ed.). Proceedings of the 13th International  Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation. Brno: Institute of Scientific Instruments AS CR, v.v.i,  2012, S. 37-38. ISBN 978-80-87441-07-7. [International Seminar on  Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation /13./, Skalský dvůr, 25.06.2012-29.06.2012, CZ].
Müllerová,  Ilona; Konvalina, Ivo; Hovorka, Miloš; Mika, Filip. Approaches to the  Collection Contrast in the Immersion Objective Lens of the Scanning  Electron Microscope. In Coneference Proceedings APMC-10, ICONN 2012 and  ACMM-22. Wembley: EECW Pty Ltd, 2012, 410:1-2. ISBN 978-1-74052-245-8.  [Asia-Pacific Microscopy Conference (APMC-10) - International Conference  on Nanoscience and Nanotechnology (ICONN 2012) - Australian Conference  on Microscopy and Microanalysis (ACMM-22), Perth, 05.02.2012-09.02.2012,  AU].
Müllerová, Ilona; Konvalina, Ivo; Mika, Filip. Collection  contrast in the immersion objective lens of the scanning electron  microscope. In Mika, F. (ed.). Proceedings of the 13th International  Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation. Brno: Institute of Scientific Instruments AS CR, v.v.i,  2012, -, -, s. 49-50. ISBN 978-80-87441-07-7. [International Seminar on  Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation /13./, Skalský dvůr, 25.06.2012-29.06.2012, CZ].
Müllerová,  Ilona; Konvalina, Ivo; Mika, Filip. Collection contrast in the  immersion objective lens of the scanning electron microscope. In Mika,  F. (ed.). Proceedings of the 13th International Seminar on Recent Trends  in Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation. Brno:  Institute of Scientific Instruments AS CR, v.v.i, 2012, S. 49-50. ISBN  978-80-87441-07-7. [International Seminar on Recent Trends in Charged  Particle Optics and Surface Physics Instrumentation /13./, Skalský dvůr,  25.06.2012-29.06.2012, CZ].
2011
Burešová,  I.; Dvořáková, P.; Hřivna, L.; Mika, Filip. Realtionship between  protein content, bread-making quality and wheat endosperm  microstructure. In Proteiny 2011. Sborník příspěvků VI. ročníku  mezinárodní konference. Zlín: Univerzita Tomáše Bati, 2011, S. 36-39.  ISBN 978-80-7454-022-6. [Proteiny 2011 /4./, Zlín,  03.05.2011-04.05.2011, CZ].
2010
Matějka,  Milan; Rek, Antonín; Mika, Filip; Fořt, Tomáš; Matějková, Jiřina.  Comparison of techniques for diffraction grating topography analysis. In  Mika, F. (ed.). Proceedings of the 12th International Seminar on Recent  Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation.  Brno: Institute of Scientific Instruments AS CR, v.v.i, 2010, S. 29-32.  ISBN 978-80-254-6842-5. [International Seminar on Recent Trends in  Charged Particle Optics and Surface Physics Instrumentation /12./,  Skalský dvůr, 31.05.2010-04.06.2010, CZ].
Mika, Filip; Hovorka,  Miloš; Frank, Luděk. Imaging of dopants under presence of surface  ad-layers. In Mika, F. (ed.). Proceedings of the 12th International  Seminar on Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation. Brno: Institute of Scientific Instruments AS CR, v.v.i,  2010, S. 35-36. ISBN 978-80-254-6842-5. [International Seminar on  Recent Trends in Charged Particle Optics and Surface Physics  Instrumentation /12./, Skalský dvůr, 31.05.2010-04.06.2010, CZ]. 
Proceedings Paper - Czech Conference
2013
Frank,  Luděk; Nebesářová, Jana; Vancová, Marie; Paták, Aleš; Müllerová, Ilona.  Very low energy STEM for biology. In Mikroskopie 2013. Praha:  Československá mikroskopická společnost, 2013, S. 19. [Mikroskopie 2013,  Lednice, 13.05.2013-14.05.2013, CZ].
Novotný, Peter; Konvalina,  Ivo; Mika, Filip; Müllerová, Ilona. Simulation of electron trajectories  in thin foils and electromagnetic fields of STEM. In Mikroskopie 2013.  Praha: Československá mikroskopická společnost, 2013, S. 63.  [Mikroskopie 2013, Lednice, 13.05.2013-14.05.2013, CZ].
Collaborative Research
2024
Mika, F., Pokorná, Z., Motlová, T. Kalibrační struktury. Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i., 2024. Funkční vzorek APL-2024-15.
2022
Mika, F., Krátký, S., Pokorná, Z. Kalibrační standard pro metodu spektroskopii sekundárních elektronů v SEM. Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i., 2022. Funkční vzorek APL-2022-11.
2021
Mika, F., Pokorná, Z., Dupák, L. Manipulátor s mikrometrickým posuvem pro miniaturizovaný spektrometr sekundárních elektronů. Ústav přístrojové techniky AV ČR, v. v. i., 2021. Funkční vzorek APL-2021-06.
2020
Mika, Filip, Dupák, Libor, Pokorná, Zuzana. Manipulátor držáku vzorku spektrometru s mikrometrickým posuvem a spektrometr s uvedeným manipulátorem. Užitný vzor 34364. 8. 9. 2020.
2019
Mika, Filip, Dupák, Libor, Pokorná, Zuzana. Miniaturizovaný analyzátor sekundárních elektronů. 2019. 
Mika,  Filip, Dupák, Jan, Pokorná, Zuzana. Spektrometr pozorovací komory  rastrovacího elektronového mikroskopu a rastrovací elektronový mikroskop  s pozorovací komorou tento spektrometr obsahující. 2019. Brno : Ústav  přístrojové techniky AV ČR, v. v. i., 26.11.2019.
Contractual Research
2024
Mika, F. SMV-2024-30: Morfologie a diagnostika diamantu podobných brusných prášků. Brno: EID Ltd., 2024.
Mika, F. SMV-2024-31: Morfologie a diagnostika výkonových prvků. Brno: Innomotics, s.r.o., odštěpný závod Elektromotory Drásov, 2024.
Mika, F. SMV-2024-32: Morfologie a diagnostika silových prvků. Brno: THK RHYTHM AUTOMOTIVE CZECH, a.s., 2024.
2023
Mika, F. SMV-2023-53: Morfologie a diagnostika diamantu podobných brusných prášků. Brno: EID Ltd., 2023.
2022
Mika, F. SMV-2022-02: Vývoj spektrometru SE elektronů. Brno: A. Khursheed, 2022. 
Mika, F. SMV-2022-03: Morfologie a diagnostika spektrometrových zrcadel v SEM. Brno: Tomra Sorting s.r.o., 2022.
Mika, F. SMV-2022-04:  Vypracování metodiky pro morfologickou a prvkovou analýzu  experimentálních a archeologických vzorků kostí a sedimentů na  rastrovacím elektronovém mikroskopu. Brno: Archeologický ústav AV ČR Brno, v. v. i., 2022.
Mika, F. SMV-2022-05: Mapování procesu fragmentace krystalů API. Brno: Ratiochem, s.r.o., 2022.
2021
Mika, F. SMV-2021-35: Mapování procesu fragmentace krystalů API. Brno: Ratiochem, s.r.o., 2021. 6 s.
Mika, F. SMV-2021-36:  Vypracování metodiky pro morfologickou analýzu experimentálních a  archeologických vzorků kostí na rastrovacím elektronovém mikroskopu. Brno: Univerzita Hradec Králové, 2021. 20 s.
Mika, F. SMV-2021-37: Analýza mikrostruktury a chemického složení solenoidu. Brno: EGSTON SYSTEM ELECTRONIC, spol. s r.o., 2021. 7 s.
Mika, F. SMV-2021-38: Vypracování metodiky prvkového mapování řezu kovů na rastrovacím elektronovém mikroskopu. Brno: Cronite CZ s.r.o., 2021. 7 s.
Mika, F. SMV-2021-39: Vypracování metodiky charakterizace ASIC Chipu. Brno: Braiins Systems s.r.o., 2021. 3 s.
2020
Matějka, Milan, Horáček, Miroslav, Meluzín, Petr, Chlumská, Jana, Kolařík, Vladimír, Krátký, Stanislav, Pokorná, Zuzana. SMV-2020-23: Vývoj testovacích preparátů pro REM. Brno: Tescan Brno s.r.o., 2020. 8 s.
Mika, Filip. SMV-2020-50: Mapování procesu fragmentace krystalů API. Brno: Ratiochem, s.r.o., 2020. 6 s.
Mika, Filip. SMV-2020-51: Analýza mikrostruktury a chemického složení syntetických diamantových prášků. Brno: EID Ltd., 2020. 3 s.
Mika, Filip. SMV-2020-52: Vypracování metodiky prvkového mapování řezu ocelí na rastrovacím elektronovém mikroskopu. Brno: Cronite CZ, 2020. 7 s.
2019
Mika, Filip. SMV-2019-13: Chemická  expertíza měděných vzorků odebraných z prototypu nového motoru v rámci  jeho vývoje. Brno: Siemens Electric Machines s r.o., 2019. 5 s. 
Mika,  Filip. SMV-2019-14: Morfologická analýza pyrolytického grafitu v  bazální a hranové orientaci pro biofyzikální výzkum. Brno: Biofyzikální  ústav AV ČR, v.v.i., 2019. 6 s. 
Mika, Filip. SMV-2019-15:  Vypracování metodiky chemické analýzy řezu austenitickou ocelí na  rastrovacím elektronovém mikroskopu. Brno: Cronite CZ, 2019. 3 s. 
2014
Mika, Filip. SMV-2014-03: Analýza mikrostruktury syntetických diamantových prášků. Brno: EID Ltd, 2014. 2 s.
Mika,  Filip. SMV-2014-18: Analýza mikrostruktury a materiálového složení v  prozařovacím režimu. Brno: Contipro Boiotech, 2014. 2 s.
2013
Mika,  Filip; Paták, Aleš. SMV-2013-03: Analýza mikrostruktury a materiálového  složení anorganických nanočástic. Brno: Contipro Biotech s.r.o, 2013. 4  s.
Mika, Filip; Paták, Aleš. SMV-2013-06: Analýza mikrostruktury  a chemického složení syntetických diamantových prášků. Brno: EID Ltd,  2013. 4 s.
 
        









